A diversidade da fauna en Turquía é aínda maior que a das plantas silvestres. Aínda que o número de especies en toda Europa ronda as 60,000, en Turquía son máis de 80,000. Se tamén se contan subespecies, entón este número ascende a máis de cen mil.
Como no caso das plantas, Anatolia é a patria orixinal de varias especies. Por exemplo, o gamo, agora común en Europa, foi introducido desde Turquía no século XVII. Esta especie provén das estribacións das montañas Taurus entre Antalya e Adana. Outro exemplo é o faisán que vén de Samsun na costa de Mar Negro de Turquía. O nome científico desta fermosa ave é Phasianus colchicus, "Phasianus" é o antigo nome do río Kizilirmak, e "colchicus" deriva de Colhia, un antigo reino que se estendía pola costa do Mar Negro ata o Cáucaso. A ovella doméstica é un descendente da ovella salvaxe, Ovis musimon anatolica, que, como o nome científico indica, era orixinaria de Anatolia. Poucas persoas saben que o leopardo de Anatolia é un dos máis grandes destes graciosos gatos, e que era a especie que os romanos usaban nas loitas de gladiadores construídas como trampas para estas criaturas aínda se poden ver espalladas nas montañas Taurus e son coñecidas. localmente como trampas para tigres. De feito, o tigre é outra criatura cuxa terra natal orixinal foi Anatolia, feito pouco coñecido reflectido no propio nome de tigre, que provén do nome latino Felis Tigris, ou gato Tigris despois do río Tigris. Os leóns que hoxe só sobreviven nas estatuas hititas foron un membro máis da fauna de Anatolia.
As aves aproveitaron a posición estratéxica de Turquía como ponte que une Europa con Asia e África durante miles de anos. Dúas das catro principais rutas migratorias da rexión bioxeográfica coñecida como ano, en primavera e outono. Na primavera as aves migratorias voan cara ao norte de África a Asia e Europa, e no outono abandonan os seus lugares de cría para voar de novo cara ao sur cara a África. Unha destas rutas migratorias leva ao sur desde Hopa, no nordeste de Turquía, ao longo do val do río Çoruh ata o leste de Anatolia, pasando por Kahramanmaras e Antakya no sueste de Turquía. A maioría das aves que percorren esta ruta polo val do río Çoruh son aves rapaces, e preto de 250,000 proceden do maior grupo migratorio de aves rapaces do mundo. Non obstante, a migración máis espectacular do mundo é o voo de cegoñas polo Bósforo en Estambul en primavera e outono. Máis dun cuarto de millón de cegoñas voan en nubes sobre a cidade no transcurso dunhas poucas semanas. Algunhas especies de aves rapaces tamén migran ao longo do Bósforo, unha vía fluvial que non só é unha ruta migratoria para as aves senón tamén para os peixes que se abren paso entre o Mar Negro e o mar de Mármara. É este fenómeno o que resulta en capturas inusualmente altas, que fan as delicias dos pescadores e dos seus clientes.
A pesar de que Turquía é unha terra antiga, atravesada, explotada e buscada por unha sucesión de pobos durante milenios, aínda hai moitas áreas que permaneceron practicamente intactas, o que permite manter moitas especies raras de fauna salvaxe que se extinguiron noutros lugares. colonias viables aquí. As costas do Exeo e do Mediterráneo de Turquía ofrecen un refuxio para as focas monxes e as tartarugas bobas, mentres que os humidais albergan colonias de numerosas especies en perigo de extinción, como o pelícano dálmata, o corvo mariño pigmeo e o rizoma de pico delgado, así como flamencos, patos e gansos.
Baixo os auspicios do Ministerio de Medio Ambiente está en marcha un programa para proxectar as últimas colonias de foca monxe que quedan ao longo das costas do Mediterráneo e do Exeo de Turquía e, ademais, está a levarse a cabo un proxecto internacional no marco dos convenios de Berna e Barcelona. Ademais dunha pequena colonia de focas monxes nas costas do Sáhara Occidental no Océano Atlántico, as únicas colonias que quedan desta especie son o Mediterráneo oriental, xa que a especie foi eliminada nas zonas occidentais. O feito de que a especie sobreviva nas costas de Turquía débese á preservación do medio natural en moitas zonas e aos baixos niveis de contaminación. Outra evidencia de que a conservación ambiental ao longo da costa de Turquía está a ter éxito é a existencia continuada de bosques de piñeiros e longas praias virxes a pesar das grandes construcións nos últimos anos. As focas vense en menor medida no Mármara e o Mar Negro, pero son máis comúns ao redor de Foça, preto de Esmirna, na costa do Exeo, unha cidade cuxo nome deriva do antigo fenicio para selo. Un comité de focas local instalou cervexa na cidade, seguido por outro en Yalikavak, preto de Bodrum, máis ao sur.
O número total de focas monxes no mundo está entre 300 e 400, cincuenta das cales viven en augas turcas.
Outras especies en perigo de extinción son as tartarugas que poñen os ovos nas longas praias de area do Mediterráneo. Dúas especies crían en Turquía, onde os esforzos por protexelas tiveron un gran éxito. Un proxecto de desenvolvemento turístico en Köycegiz foi descartado para preservar os lugares de cría de Caretta Caretta, e o lago e as marismas de Köycegiz declaráronse Zona Especialmente Protexida. Estas medidas foron recibidas cunha gran ovación polo Comité Permanente da Convención de Berna do Consello de Europa en 1989, e citadas como exemplo a seguir por outros países. Puxéronse en marcha estudos sobre as tartarugas ao longo de todas as costas de Turquía e o Comité de Preservación das Tartarugas mantén baixo observación constante dezasete praias de area de máxima importancia como zonas de cría de tartarugas. A Autoridade de Áreas Especialmente Protexidas do Ministerio de Medio Ambiente é a encargada de protexer a zona de Belek, e o Ministerio de Silvicultura é responsable dos humidais de Yumurtalik e Akyatan.
