Ang Tarsus, na naging mahalagang sentro ng kultura ng Çukurova sa mga makasaysayang panahon, ay patuloy na naging sentro ng paninirahan at kultura mula 7000 BC hanggang ngayon.
Nakuha ng Tarsus ang atensyon ng mga dayuhang manlalakbay sa pagitan ng ika-17 at ika-18 siglo at naging isang lugar na madalas puntahan ng mga dayuhang mananaliksik. Dahil sa mga isinagawang pananaliksik, tumaas ang kahalagahan ng Tarsus sa kasaysayan ng Çukurova. Ang kultural na data na nakuha sa mga siyentipikong paghuhukay na isinagawa ni Hetty Goldman sa Gözlükule Tumulus na nasa Tarsus settlement center sa pagitan ng 1937-1948 ay nagbigay liwanag sa sinaunang kasaysayan ng Çukurova. Ang mga movable cultural values na nakuha mula sa paghuhukay na ito ay inilipat sa Adana Museum, na siyang pinakamalapit na museo. Higit pa rito, ang mga mosaic na kabilang sa 3rd - 4th century AD, na natagpuan sa base excavation ng courthouse building na ginawa sa sentro ng lungsod ay ipinapakita sa Hatay Museum ngayon.
Ang istrukturang pangkasaysayan sa ilalim ng lupa at ang kapal ng mga makasaysayang arkitektura na opus na matatagpuan sa mga kalye at daan ng modernong sentro ng pamayanan ng Tarsus at ang malaking bilang ng mga opus na natagpuan sa mga paghuhukay sa sentro ng lungsod ay nagsilang ng kaisipang magtatag ng isang museo sa Tarsus para sa unang pagkakataon noong 1969 – 1970.
Ang museo ay nagsimulang mabuo gamit ang mga opus na sinimulang kolektahin noong 1969 sa Kubad Paşa madrasa na itinayo ni Kubad Paşa na isa sa mga master ng Ramazanoğlu, sa Ramazanoğulları Principality na itinatag sa Çukurova noong 1450 AD sa lungsod. gitna; at noong 1971, ang museo ay pormal na binuksan sa distrito.
Sa gusali ng museo, bukod sa mga movable architectural opuses na matatagpuan sa Tarsus center at nakapalibot, isang kabuuang 35.000 opuses na nakuha sa pamamagitan ng pagbili, pagkumpiska, paghuhukay ay ipinakita. Dahil ang kasalukuyang gusali ng museo ay hindi sapat, ang mga gawain para sa pagbubukas ng bagong modernong gusali ng museo sa ika-75 taon ng Tarsus Culture Center Building na matatapos sa 1998, ay nagpapatuloy. Gayundin, ang pagsasaayos at pagsasaayos ng layout ay nagpapatuloy sa St. Paul Church na nanatili mula ika-18 hanggang ika-19 na siglo upang bigyang-daan ang turismo ng paniniwala sa taong 2000.
