Bilang resulta ng mga archaeological excavations na nagsimula sa Bergama noong 1878 sa ilalim ng direksyon nina Carl Humman at Alexander Conze, isang depot museum ang itinayo malapit sa German Excavation House ngayon sa panahon ng mga paghuhukay na ginawa sa acropolis sa pagitan ng mga taong 1900 - 1913. Ang depot na ito ay isa sa dalawang archaeological opus depot na umiral sa Turkey noong panahong iyon. Ang mga paghuhukay sa Bergama, na naantala dahil sa 1st World War, ay muling sinimulan sa ilalim ng direksyon ni Theodor Wiegand. Sa parehong taon, sa pagsisimula ng mga paghuhukay sa Asklepieion bilang karagdagan sa mga paghuhukay sa acropolis, ang bilang ng mga opus ay dumami at kailangan ng isang bagong gusali ng museo.
Si Marshall Fevzi Çakmak, na dumating sa Bergama noong 1932 ay malapit na interesado sa isyu at iniutos ang pundasyon ng isang bagong museo pagkatapos ng kanyang pagbisita. Para sa bagong gusali na binalak na itayo kasama ng Turkish at German cooperation, ang lokasyon ngayon na isang lumang sementeryo ay nakitang angkop. Ang proyekto na inihanda ng mga arkitekto na sina Bruno Meyer at Harold Hanson ay natapos sa pagtatapos ng 1932 at ang mga gawain para sa base excavation ay sinimulan noong 1933 sa pormal na kahilingan ng gobernador ng İzmir, Kazım Dirik. Si Mustafa Kemal Atatürk, na bumisita sa Asklepieion, na isang health center, sa kanyang pagbisita sa Bergama noong Abril 13, 1934, ay nakita na ang pagtatayo ng gusali ng museo ay nagpapatuloy.
Ang museo ng Bergama, na natapos na ang pagtatayo, ay binuksan para bisitahin noong Oktubre 30, 1936 ng gobernador ng İzmir, Fazlı Güleç. Ang gusali ng museo ay binubuo ng isang malaking hugis-parihaba na patyo na napapalibutan ng mga gallery, at isang hugis-parihaba na exhibition hall sa likod ng patyo na ito. Dahil ang mga gallery ng courtyard ay angkop para sa open-air museum, ang mga opus ay ipinakita doon. Nang ang Ethnography and Archaeology Museum ay pinaandar sa gusali ng Bergama Public House noong 1924, ang mga archaeological opus ay dinala sa bagong gusali ng museo. Ang mga etnograpikong opus ay dinala sa gusali ng museo ngayon noong 1979 pagkatapos ng pagtatayo ng karagdagang gusali. Ang karagdagang gusali ay may hugis-parihaba na plano na inilagay sa tabi ng bahagi, kung saan umiiral ang patyo at bulwagan ng eksibisyon, ang pasukan nito ay ibinibigay sa pamamagitan ng pagbubukas ng pinto mula sa patyo patungo sa bulwagan. Ang mga yunit tulad ng depot, laboratoryo, silid ng litrato, archive ay idinagdag sa kabilang panig ng museo na naiwan na walang laman at sa likurang bahagi nito.
Karamihan sa mga archaeological opuses sa museo, na nabibilang sa iba't ibang mga panahon mula sa unang bahagi ng panahon ng tanso hanggang sa Byzantine Period, ay natagpuan sa mga paghuhukay na ginawa sa Bergama at sa paligid nito. Kabilang sa mga nahanap na matatagpuan sa mga archaic residences sa paligid, ang mga sample na kabilang sa Pergfamon sculpture school, ang Archaic Period finds na nagmumula sa Pitane at Gryneon, Myrina terracotta ay nakakakuha ng pansin. Sa seksyong etnograpiya, ipinakita ang mga carpet, kilim ng rehiyon (Yuntdağ, Yağcıbedir, Kozak, Bergama weavings), mga sample ng paghabi ng tela, mga gawa ng kamay at iba pang gawang kamay na pagmamay-ari ng ibang mga rehiyon ng Anatolia.
