Raznolikost faune u Turskoj čak je veća od one divljih biljaka. Dok je broj vrsta širom Evrope u celini oko 60,000, u Turskoj ih ima preko 80,000. Ako se računaju i podvrste, onda se ovaj broj penje na preko sto hiljada.
Kao iu slučaju biljaka, Anadolija je izvorna domovina nekoliko vrsta. Na primjer, jelen lopatar koji je danas uobičajen u Evropi uveden je iz Turske u 17. vijeku. Ova vrsta dolazi iz podnožja planine Taurus između Antalije i Adane. Drugi primjer je fazan koji dolazi iz Samsuna na turskoj obali Crnog mora. Naučno ime ove prelepe ptice je Phasianus colchicus, "Phasianus" je drevni naziv za reku Kizilirmak, a "colchicus" potiče od Colhia, drevnog kraljevstva koje se protezalo duž obale Crnog mora do Kavkaza. Domaća ovca je potomak divlje ovce Ovis musimon anatolica, koja je, kako naučni naziv govori, porijeklom iz Anadolije. Malo ljudi zna da je anatolski leopard jedna od najvećih od ovih gracioznih mačaka, i da je to vrsta koju su Rimljani koristili u borbama gladijatora, a koju su pravili kao zamke za ova stvorenja, još uvijek se mogu vidjeti raštrkane u planinama Taurus i poznate su lokalno kao zamke za tigrove. Zaista, tigar je još jedno stvorenje čija je prvobitna domovina bila Anadolija, što je malo poznata činjenica koja se ogleda u samom nazivu tigar, koje dolazi od latinskog imena Felis Tigris, ili Tigris mačka po rijeci Tigris. Lavovi koji su danas preživjeli samo u hetitskim kipovima nekada su bili još jedan od članova anatolske faune.
Ptice su hiljadama godina iskoristile stratešku poziciju Turske kao mosta koji povezuje Evropu sa Azijom i Afrikom. Dva od četiri glavna migraciona puta u biogeografskoj regiji poznata kao godina, u proljeće i jesen. U proleće ptice selice lete na sever iz Afrike u Aziju i Evropu, a u jesen napuštaju svoja gnezdilišta i ponovo lete na jug u Afriku. Jedna od ovih migracijskih ruta vodi južno od Hope na sjeveroistoku Turske duž doline rijeke Çoruh u istočnu Anadoliju, prolazeći kroz Kahramanmaras i Antakyu u jugoistočnoj Turskoj. Većina ptica koje idu ovim putem kroz dolinu rijeke Çoruh su ptice grabljivice, a sa oko 250,000 su iz najveće migratorne grupe ptica grabljivica na svijetu. Ipak, najspektakularnija migracija na svijetu je let roda niz Bosfor u Istanbulu u proljeće i jesen. Više od četvrt miliona roda leti u oblacima iznad grada u toku nekoliko sedmica. Neke vrste ptica grabljivica migriraju i duž Bosfora, plovnog puta koji nije samo migratorni put za ptice već i za ribe koje se probijaju između Crnog i Mramornog mora. Upravo ovaj fenomen rezultira neuobičajeno visokim ulovom, oduševljava ribare i njihove kupce.
Unatoč činjenici da je Turska drevna zemlja, koju su ljudi prelazili, eksploatirali i tražili milenijumima, još uvijek postoje mnoga područja koja su ostala praktički netaknuta, omogućavajući mnogim rijetkim vrstama divljih životinja koje su postale ugrožene ili izumrle na drugim mjestima. održive kolonije ovdje. Turske egejske i mediteranske obale pružaju utočište za medvjedice i glavate kornjače, dok su močvarna područja naseljavaju kolonije brojnih ugroženih vrsta, poput dalmatinskog pelikana, malog kormorana i vitkog kljuna, kao i flaminga, divljih pataka i geesa.
Pod pokroviteljstvom Ministarstva životne sredine u toku je program projektovanja poslednjih preživelih kolonija medvjedice duž turskog Mediterana i Egejske obale, a pored toga se sprovodi i međunarodni projekat u okviru Bernske i Barselonske konvencije. Osim male kolonije medvjedica na obalama Zapadne Sahare na Atlantskom okeanu, jedine preostale kolonije ove vrste su istočni Mediteran, a vrsta je izbrisana u zapadnim područjima. Činjenica da je vrsta opstala duž turskih obala je zbog očuvanja prirodnog okruženja u mnogim područjima i niskog nivoa zagađenja. Daljnji dokaz da očuvanje okoliša duž turske obale uspijeva je kontinuirano postojanje borove šume i dugih netaknutih plaža uprkos ekstenzivnoj izgradnji posljednjih godina. Foke se u manjoj mjeri mogu vidjeti u Mramornom i Crnom moru, ali su najčešće oko Foče, blizu Izmira, na obali Egejskog mora, grada čije ime potiče od drevnog feničanskog za foku. Lokalni komitet za pečate je osnovan u gradu, a zatim još jedan u Yalikavak blizu Bodruma dalje na jugu.
Ukupan broj medvjedica u svijetu je između 300-400, od kojih pedeset živi u turskim vodama.
Druge ugrožene vrste uključuju kornjače koje polažu jaja na dugim pješčanim plažama Mediterana. Dvije vrste gnijezde se u Turskoj, gdje su napori na njihovoj zaštiti bili izuzetno uspješni. Projekat razvoja turizma u Köycegizu je ukinut kako bi se očuvala uzgajališta Caretta Caretta, a jezero i močvare Köycegiz proglašeni su Posebno zaštićenim područjem. Ove mjere su dočekane sa ovacijama od strane Stalnog komiteta Bernske konvencije Vijeća Evrope 1989. godine i navedene kao primjer za druge zemlje. Pokrenuta su istraživanja o kornjačama duž svih obala Turske, a sedamnaest pješčanih plaža od najveće važnosti kao mjesta za razmnožavanje kornjača drži pod stalnim nadzorom Komiteta za očuvanje kornjača. Uprava za posebno zaštićena područja Ministarstva životne sredine zadužena je za zaštitu područja Beleka, a Ministarstvo šumarstva nadležno je za močvare Yumurtalik i Akyatan.
